Visualisierung Medizinischer Daten 2

VU Visualisierung Medizinischer Daten 2
WS 2.0, 186.138

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Ort und Zeit
Inhalte

Ort und Zeit

Vorlesung: Diese Vorlesung findet im WS2007/2008 nicht statt!!

Inhalte

Die Vorlesung Visualisierung Medizinischer Daten 2 wird sich mit konkreten Anwendungen der medizinischen Visualisierung beschäftigen. Während in der Vorlesung "Visualisierung Medizinischer Daten 1" vor allem auf allgemeine Konzepte eingegangen wurde, steht jetzt deren praktische Anwendung im Vordergrund.

Themen:

Planung und Training von Operationen
Virtuelle Endoskopie
Segmentierung zeitabhängiger Daten
Darstellung multimodaler Daten
Physikalisch basierte Simulation von Gewebe
Spezielle Rendering Methoden
Augmented Reality in der Medizin
Visualisierung großer Datenmengen
Atlas basierte Segmentierung
Hardware basierte Visualisierung, Segmentierung und Simulation

Bei der Themenwahl kann auf die Wünsche der Teilnehmer eingegegangen werden!

Die Vorlesung wird teilweise in Form von Reading Assignments abgehalten.

Im ersten Teil der Vorlesung gibt die Vortragende einen Überblick über aktuelle Themen der Medizinischen Visualisierung. Dabei wird vor allem Wert auf anwendungsorientierte Forschung mit konkretem medizinischen Hintergrund gelegt und durch Beispiele aus der Praxis verdeutlicht. Basis hierfür bilden unter Anderem die aktuelle Forschungsprojekte der Forschungsgruppen Medizinische Visualisierung des VRVis und Scientific Visualization des Institutes für Computergraphik.

Grundlage für den zweiten Teil der Vorlesung bilden aktuelle Publikationen, die von den Hörern in Form von Vorträgen und Diskussionen erarbeitet werden. Da es sich um eine VU handelt, wird erwartete, dass jeder Teilnehmer einen Vortrag zu einem der oben genannten, oder einem selbst gewählten, Thema vorbereitet und präsentiert.

Ziel dieser VU ist es,

einen tiefen Einblick in die aktuelle Forschungslandschaft im Bereich medizinische Visualisierung zu geben,
zu lernen eine wissenschaftliche Publikation sukzessive zu erarbeiten, zu analysieren, samt Hintergrundwissen aufzubereiten und verständlich (!) zu präsentieren.

Beide Ziele bilden die unverzichtbare Grundlage für eine solide wissenschaftliche Arbeit in diesem Bereich (und nicht nur dort!).

Aktuelles

Die Folien, die in der Vorbesprechung gezeigt wurden enthalten aktuelle Hintergrundinformationen zur Vorlesung: Vorbesprech_WS2005.pdf.
Die folgende Tabelle zeigt Themen, die in der Vorbesprechung vorgestellt, und an Vortragende vergeben wurden. Es gibt noch offene Themen - noch kann bei der Vorlesung eingestiegen werde!

Thema	Material	Teilnehmer
Design of Transferfunctions for Direct Volume Rendering What are Transferfunctions? What are currently the problems? Interfaces for transfer function design How can we simplify and accelerate the design process for transferfunctions? How can we incorporate existing expert knowledge and high level information to accelerate and simplify the design process?	Search Google for transfer function volume rendering and 2005 (for the newest publications) Discussion on Interfaces for TF Design (mainly section: 3.4 and related literatur): Melanie Tory, Torsten Moller. Human Factors in Visualization Research. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics,January-February 2004 - (Vol. 10, No. 1) pp. 72-84	Eva-Maria Michelcic
Visualization of Multi-Modal Data How can we combine data from different imaging modalities?	Starting Point IDM Lab, Université Rennes: http://idm.univ-rennes1.fr/theme1gb.html	Phillip Muig
Illustrative Rendering Why are illustrations important? What do we need them for? Classical illustration techniques? How can we automatically generate illustrations from medical data for education and publications?	Search Goole for illustrative rendering medical - you will find a lot of material ;o)	Jürgen Knoth
Visualization of Data for Diagnosis and Intervention Planning in Neurosurgery Medical / Technical Background Visualization Specific Transferfunctions for the Application Validation and Standardization	Staring Point: Publications of Hastreiter and Vega on Intracarnial Aneurhisms: http://www9.informatik.uni-erlangen.de/Persons/Vega/publications	Josef Diermaier
Planning of Neck Dissections Medical Background Segmentation Visualization	HNO Projekt Magdeburg: http://isgwww.cs.uni-magdeburg.de/cv/projects/dfgHNO/index.html	Gerhard Aigner
Planning of Liver Surgery Medical Background Preprocessing: Segmentation, Model building Intraoperative Support Augemted Reality ....	Leberprojekt Mevis Bremen: http://www.mevis.de/projects/liver/ Liver Surgery Trainer Magdeburg: http://isgwww.cs.uni-magdeburg.de/cv/projects/LST/index.html Liver Surgery Planner Graz: http://www.icg.tu-graz.ac.at/Research	Andreas Schöllhuber Karin Gisperg
Visualization of Diffusion Tensor Imaging Data Medical Background Image Aquisition Techniques Visualization of Tensor Data	Good Starting Points: Introduction by Zhang et al. http://www.cs.brown.edu/research/vis/docs/pdf/Zhang-2004-DTM.pdf Publications of Merhof, Erlangen http://www9.informatik.uni-erlangen.de/Persons/Merhof/Publications/ Visualization Research Lab Brown University http://www.cs.brown.edu/research/vis/areas/themes/medicine.html#PUBS Newest Results: Publications of IEEE Visualization 2005: http://vis.computer.org/vis2005/session/papers.html#p3	Stephan Witoszynsky
Automatic Segmentation and Labeling of MR Data of the Brain Anatomic Atlases Preprocessing of Data "Skull Stripping" ....	UCLA Brain Suite and Related Publications: http://brainsuite.usc.edu/ Arbeiten von Gudrun Wagenknecht: z.B.: http://www.fz-juelich.de/zel/roi_neu.pdf und neuere Publikationen.	Richard Springle

Prüfungsmodus

Um Vorlesung und Übung erfolgreich abzuschließen, muss ein Vortrag über eine Publikation in den obene genannten Gebieten gehalten werden und eine kleine Ausarbeitung geschrieben werden. Folgende Kriterien spielen bei der Bewertung eine Rolle:

Präsentation der Inhalte
Aufarbeitung von Hintergrundwissen
Präsentationstechnik
Ausarbeitung

Es herrscht Anwesenheitspflicht bei allen Terminen!